大司马、梁王萧衍准备杀掉齐国诸王，但是防守并不很严密，鄱阳王萧宝寅家中名叫颜文智的宦官，同手下叫麻拱的几个人密谋，在夜间凿穿了墙壁把萧宝寅送出了王宫，在江岸边准备了小船。萧宝寅身上穿着乌布短衣，腰间系了千余钱，偷偷地来到江边，就穿着草鞋步行，脚上没有一块完好的皮肤。
防守他的人天亮发现后去追他，萧宝寅假装成钓鱼的人，同追他的人在江中并舟而行了十几里，追赶的人都没有怀疑他，等到追捕的人散去，他才渡过长江到了北岸，投宿在老百姓华文荣的家里。华文荣与他的族人天龙、惠连抛弃家室，将萧宝寅带到山沟里隐藏了起来。
他们租了一匹驴子让萧宝寅骑，白天里隐蔽，黑夜里行走，终于到达了寿阳的东城。北魏戍守东城的首领杜元伦，火速派人把这一情况，报告了北魏扬州刺史任城王元澄，元澄连忙派遣车马侍卫迎接了萧宝寅。
萧宝寅这时年纪十六岁，徒步而行，脸融憔悴，路上看见的人还以为是被掠卖的人口。元澄以宾客的礼节接待他，萧宝寅要求借给他为国君居丧的斩衰丧服，元澄派人向他说明了情形和可行的礼节，给了他为兄居丧的齐衰之服。
同时，元澄还带领官僚也来吊唁，萧宝寅的一举一动很合礼仪，完全与丧君的礼节相同，元澄非常器重萧宝寅。寿阳地方有许多受过南齐恩惠的故旧都前往吊唁，只有夏侯氏一族的人没有去，这是因为夏侯氏已跟随了梁王萧衍的缘故。
荆州经过战争之后，公家和私人都穷困匮乏，萧憺励精图治，推广屯田制度，减少各项劳役，慰问战死士兵的家庭，供给他们钱粮，萧憺觉得自己年轻而担负重任，就对手下的官吏们说：“国政不良，是士君子所共同叹息的。我现在虚心听取大家的意见，你们可要知无不言！”
于是人人可以把自己的意见完全说出，百姓有诉讼的，都站到官署前等待判决，事情一会儿就办好了，官署没有留到隔日的讼事，荆州人非常悦服，于是任命萧憺为都督荆、湘等六州诸军事，荆州刺史，又下诏禅让君位给梁王萧衍。
宣德太后下令说：“西边的诏书已到，皇帝效法前代的制度，恭敬地把帝位禅让给梁王。明天早晨可到郊坛，派遣使者恭敬地把玺绂交给梁王，我这个未亡人从即日起就回别宫居住。”
于是发布诏书，派遣兼太保、尚书令王亮等人奉送皇帝的玺绂到梁宫，于是梁王萧衍在南郊即任皇帝位，大赦天下，改年号为天监。同一天，追赠皇兄萧懿做宰相，封为长沙王，谥号宣武，并按照晋安平献王的旧例，为他举行葬礼。
尊奉和帝萧宝融为巴陵王，王宫建在姑孰，崇奉优厚的礼节，完全按照齐初禅让的旧例，奉宣德太后为齐文帝妃，王皇后做巴陵王妃，齐代所有王、侯的封爵，一律依此降级削除封国，只有宋汝阴王不在削除之列。
追尊皇帝已故的父亲为文皇帝，庙号太祖，已故皇母为献皇后，追封妃子郗氏谥号为德皇后，封文武功臣车骑将军夏侯详等十五人为公、侯，封皇帝的弟弟中护军萧宏为临川王、扬州刺史，南徐州刺史萧秀为安成王，雍州刺史萧伟为建安王，左卫将军萧恢为鄱阳王，荆州刺史萧鸾做始兴王。
任命原齐国中书监王亮为尚书令，相国左长史王莹为中书监，吏部尚书沈约为尚书仆射，长兼侍中范云做散骑常侍、吏部尚书。诏令所有后宫、乐府、西秺、暴室的妇女一概放还回乡。
当时，萧衍打算用南海郡作为巴陵国，将和帝萧宝融迁往那儿居住，沈约说：“古今的情况不一样，魏文帝曾说：不能因为羡慕虚名而实际遭受灾祸。”
萧衍点头称是，就派手下的人郑伯禽到姑孰去，拿着生金献给萧宝融，萧宝融说：“我死何须吞下生金，只要有醇酒就可以了。”
于是喝得酩酊大醉后，郑伯禽就把他杀死了。萧宝融还在镇守荆州的时候，琅邪人颜见远是他的录事参军，等到萧宝融继承了皇位，任命颜见远为治书侍御史兼中丞。到萧宝融已经禅位给萧衍，颜见远就绝食几天而死，萧衍听到此时后说：“我自己顺应天意人命，这与天下的士大夫们有什么相干，但是颜见远竟然要这样做？”
于是下诏说：“有司依照周代和汉代的旧例，议定入金赎刑的各种条款，凡是居官而犯有鞭杖之罪的，全部可以入金赎罪停止刑罚，那些台省的令史、士卒想要入金赎罪者请便。”
东昏侯萧宝卷的宠臣孙文明等人，虽然已有赦令，他们自己仍然感到不安心，这天夜晚，他们带领数百人，利用运荻炬的机会，捆了兵仗在荻炬中间，进入南、北掖门发动叛乱，放火烧了神虎门与总章观，攻进魏尉府，杀了卫尉洮阳愍侯张弘策。
前军司马吕僧珍在殿内执勤，带领宿卫兵抵抗他们，却不能将他们击退，萧衍穿了戎装来到前殿说：“叛贼夜间来攻，这是由于他们人少的缘故，等天亮了他们就会逃走的。”
于是下令击鼓五更，领军将军王茂和骁骑将军张惠绍听说发生了变难，率兵前来救援，叛众因此开始四散逃奔，萧衍派人搜捕，将其全部诛杀。
当初，萧衍把东昏侯的余妃纳为己有，非常妨害于政事，范云因此向萧衍进谏，萧衍没有采纳他的意见，范云便同侍中、领军将军王茂一齐入见，范云说：“以前沛公进入关中，对妇女无所宠幸，这就是范增畏惧他志向远大的原因。现在您刚刚平定建康，天下的人都向往着您的名声风范，为什么要重蹈危亡败乱的覆辙，以女色连累自己的声誉呢？”
王茂起来下拜说：“范云说得对，明公您考虑的是天下大事，不应该留恋于女色。”
萧衍听了默不出声，范云便要求萧衍将余妃赏赐给王茂，萧衍认为他的心意很好，就答应了他。第二天，赏给范云、王茂二人各百万钱。
然后任命谢沐县公萧宝义为巴陵王，奉续齐朝的祭祀，萧宝义自幼身有残疾不能说话，所以独自保全了性命。征召谢胐做左光禄大夫、开府仪同三司，何胤为右光禄大夫，何点为侍中，何胤、何点最终也没有就任职位。
南康侯萧子恪和他的弟弟祁阳侯萧子范曾经因事入宫晋见，萧衍从容地对他们说：“天下是公有之物，不可以光凭力气取得，假如没有机运和天命，虽然有项藉那样的勇力，最后也要灭亡，孝武帝生性多疑猜忌，兄弟之中稍微有点好名声的都被他毒死了，朝臣中因疑似谋反而冤死的接连不断。但是有些人虽然被他猜疑却不能除掉，有些人虽不被他猜疑却终成为祸患，例如你们的祖父因才略出众被他猜疑，而最终却没能怎么样。湘东王因为平庸不被他猜疑，可是孝武帝的子孙都死在湘东王的手里。我那时已经出生，他难道知道我会有今天？由此可知有天命的人不能他人所加害得了的。我刚刚平定建康的时候，人们都劝我除掉你们这些人，以便统一人心，我当时如果按了这种建议行事，谁又能说不行呢？恰恰因为偏安江南以来，朝代的更替总是相互残杀，伤害了天地的和气，所以国运都不长。另外，齐、梁的交替，虽说也是改换天命，事情毕竟跟前代不一样，我与你们兄弟尽管不再是五服之亲，宗族的谱属究竟还不太远，齐国创造的初期，我的父皇和你们的祖上也还曾一起同过甘苦，情感同一家人相似，怎么可能一下子就彼此间疏远像过路人呢？你们兄弟果真有天命佑助，就不是我能杀得了的，如果你们没有天命佑助，我又何必匆匆忙忙要杀掉你们呢？那样只会显得没有度量罢了。况且齐明帝建武年间诛杀高帝、武帝的后代，害得你们的家门遭殃，我发动义兵，不只是为了洗刷自己家门兄弟被杀之耻，也是替你们兄弟报仇。你们如果能在建武、永元年间拨乱反正，我哪能不解除武装推举你们为帝呢？我自是从明帝手中取得政权，而不是从你们家夺取天下的。从前有个刘子舆自称是汉成帝的儿子，汉光帝刘秀说：‘假如就是成帝真的再生于今天，天下也不可失而复得，况且是冒称成帝儿子的这个刘子舆呢’？曹志是魏武帝曹操的孙子，既又是晋室的忠臣，何况你们和我仍然还是宗室之亲，我正希望我们彼此能够坦诚相待，你们不要内心自己见外啊！等过一段时间，你们肯定会明白我的这份真心的。”
萧子恪兄弟共十六人，都在梁朝做官，萧子恪、萧子范、萧子质、萧子显、萧子云、萧子晖都凭才能知名当时，担任过清高显耀的官职，每个人都善终天年，萧衍于是下诏说：“在公车府的谤木和肺石边各设立一个木箱，假如处士布衣对朝政要发表意见，而在位者又不能代言的，可投信于谤木边的箱子里，如果官吏认为自己有功劳或才能器度而枉沉下僚的，可投书在肺石边的箱子里。”
萧衍身穿洗漂过的衣服，平常佐食也只有蔬菜，每次选择长史，他总是力求挑选廉正无私的人，并把他们都召见到面前，用为政之道鼓励他们。提拔尚书殿中郎到溉为建安内史，左户侍郎刘偺做晋安太守，二人都因廉洁奉公闻名当时。到溉是到彦之的曾孙。
同时升迁山阴令丘仲孚为长沙内史，武康令东海人何远为宣城太守，所以廉洁有才能的没有不受到鼓励的，并定下法令说：“小县令有才能，升迁为大县令，大县令有才能，升迁为郡守。”